首先，Logo注册版权和商标的申请主体不同。版权一般由创作者或权利人申请，而商标则由商品或服务的生产、销售者或代理人申请。 商标是一种在商业上使用的标识符号，并且它必须被注册并通过商标局批准使用。商标需要每个国家或地区单独注册，因为在不同的国家或地区，商标的法律定义和使用规则可能会有所不同。 而版权只需申请一次，申请人通常可以获得国际认可。

其次，Logo注册版权和商标的保护范围也不同。版权保护的是原创作品，如音乐、电影、文学作品、艺术作品等。 如果版权持有人发现有人未经授权使用他们的作品，则可以向法院起诉对方侵犯版权，并获得赔偿。商标则保护的是商品或服务的来源标识。如果有人未经授权使用商标，则可能会对商标所有者的品牌声誉和财务利益造成损害。商标所有者可以向法院起诉对方侵犯商标，并要求对方停止使用商标或赔偿损失。

然后，Logo注册版权和商标的申请流程也存在一定的差异。版权通常是通过在版权局的网站上填写申请表格、支付费用并提交版权作品，最后等待版权局对申请进行审核。版权申请通常较为简单。而商标注册则要求申请人提交商标审查申请、支付注册费用、等待商标局审查和公示，以及与其他商标权利的冲突进行处理等多个步骤。因此，商标注册通常需要花费更多的时间和精力，以确保商标拥有权得到保护。

最后，Logo注册版权和商标的有效期也不同。版权在国际上通常保护作品的演绎权、复制权等权利，而商标保护可与商标权的维持和更新相关，商标的有效期更长。商标的保护期可为五至十年，但 到期后可以续订或更新，届时还需重复支付注册费用。而版权则会在创作者逝世后的特定年限内保护版权（通常在70年左右），且不需要额外的更新费用。

总结来说，Logo注册版权和商标之间的区别在于它们的定义、保护范围、申请流程和申请人资格以及有效期等方面。虽然二者都可以帮助企业、组织或个人在商业上标识其身份和标识，但它们的具体用途不同。因此，在进行商业运营时，申请人需要根据自己的需要和目的，合理地申请Logo注册版权或商标以保护自己的商业权益。